Урната с праха на професор Божидар Димитров беше разпръсната днес в Созопол. От пристанището на древна Аполония потегли кораб към остров Св. Иван. Името му се свързва и с едно от най-големите археологически открития, които донесоха световна слава на града- мощите на Йоан Предтеча. Част от праха му бе разпръсната и в Македония – земята, за която се бореше и болееше през последните години от живота си.
С решение на местния парламент Археологическия музей и улица в стария град в Созопол ще носят името на проф. Димитров.
Колеги на Божидар Димитров от Националния исторически музей също си взеха сбогом с него с емоционално писмо.